Coronavirusul sindromului respirator acut sever 2

tulpina de virus care cauzează pandemia continuă a bolii coronavirusului 2019 (COVID-19)
Acest articol se referă la tulpina virală care cauzează COVID-19. Pentru tulpina virală care cauzează SARS, vedeți Coronavirusul sindromului respirator acut sever. Pentru specia căreia aparțin ambele tulpini, vedeți Coronavirusul legat de sindromul respirator acut sever.
SARS-CoV-2
SARS-CoV-2 without background.png
Clasificare științifică
Supradomeniu[*]Biota
RegnVirus
OrdinNidovirales
FamilieCoronaviridae
SubfamilieOrthocoronavirinae
GenBetacoronavirus
Subgen[*]Sarbecovirus
SpecieSevere acute respiratory syndrome-related coronavirus
Rang necunoscut
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2[1]

Coronavirusul sindromului respirator acut sever 2 (abreviat SARS-CoV-2), numit oficial astfel de către OMS (în chineză: 2019新型冠狀病毒)[2][3], cunoscut inițial sub numele coronavirusul 2019-nCoV și popular sub numele de coronavirusul din Wuhan (în chineză simplificată: 武汉冠状病毒; chineză tradițională: 武漢冠狀病毒) și coronavirusul pneumoniei din piața de fructe de mare din Wuhan,[4] este un coronavirus ARN monocatenar cu polaritate pozitivă, care cauzează sindromul respirator acut sever 2. Primele cazuri suspecte au fost notificate către OMS pe 31 decembrie 2019[5], la doar peste trei săptămâni de la apariția primelor cazuri simptomatice pe 8 decembrie 2019[6]. Virusul a fost secvențiat genomic după teste de acid nucleic pe specimene de la un pacient cu pneumonie în timpul epidemiei de coronavirus din Wuhan din 2019-20[7][8][9].

Semne și simptomeModificare

Simptomele raportate includ febră, oboseală, tuse uscată, dificultăți de respirație și detresă respiratorie[10]. La majoritatea celor internați, semnele vitale au fost stabile la admitere, iar pacienții au prezentat leucopenie și limfopenie.

VirusologieModificare

ClasificareModificare

Acest virus face parte din familia coronavirusurilor. Acestea formează o mare familie de virusuri, iar bolile pe care le provoacă pot varia de la simpla răceală la mai multe boli grave, precum sindromul respirator din Orientul Mijlociu (MERS) și sindromul respirator acut sever (SARS). Deși coronavirusurile sunt o largă familie de virusuri, se credea că numai șase (229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV și SARS-CoV) pot infecta oameni. Astfel, 2019-nCoV a devenit al șaptelea[11].

Secvențe din betacoronavirusul Wuhan au similitudini cu betacoronavirusurile găsite la lilieci. Cu toate acestea, virusul este genetic distinct de alte coronavirusuri, precum SARS-CoV și MERS-CoV[9]. Ca și SARS-CoV, este un membru al Beta-CoV lineage B[12] (adică subgenul Sarbecovirus). Optsprezece[13] genomuri din noul coronavirus au fost izolate și raportate, printre care BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020, BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019, BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019, și BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019 de la China CDC, Institute of Pathogen Biology și Spitalul Wuhan Jinyintan[14][15]. Secvența ARN este de aproximativ 30 kb lungime. Modele structurale comparative ale proteazei coronavirusului 2019-nCoV sunt disponibile de la Innophore GmbH, care au efectuat experimente de andocare a unor medicamente[16].

Biologie structuralăModificare

Publicarea genomului a condus la mai multe experimente de modelare a proteinei receptor de legare (RBD) a proteinei nCoV spike (S). Până pe 23 ianuarie 2020, două grupuri din China consideră că proteina S păstrează suficientă afinitate cu receptorul SARS (enzima de conversie a angiotensinei 2, ACE2) pentru a fi folosită drept mecanism de intrare în celulă[17]. Dată fiind analiza fluorescentă din Shi ZL et al, este aproape sigur că 2019-nCoV folosește ACE2 drept receptor[18]. Pe 22 ianuarie, două grupuri, unul în China, care lucrează cu întregul virus, și unul în SUA, au demonstrat experimental și independent că ACE2 este receptor pentru 2019-nCoV[19][20]. O imagine la nivel atomic a proteinei S a fost creată folosind microscopie electronică criogenică[21][22].

Imagini la microscop electronic colorizate digital ale SARS-CoV-2
SARS-CoV-2 (galben) ieșind dintr-o celulă umană
Virioni SARS-CoV-2 și coroanele vizibile
SARS-CoV-2 (galben) ieșind dintr-o celulă umană

TransmitereModificare

Transmiterea directă om–om a fost confirmată în Guangdong, China, potrivit lui Zhong Nanshan, șeful comisiei de sănătate și investigare a focarului[23].

TratamentModificare

Nu există nici un tratament specific pentru acest virus disponibil în prezent, dar antivirale existente ar putea fi reutilizate[24].

RăspândireModificare

Mai jos, se afișează numărul cazurilor de îmblonăviri și decese după țară.

Date privind focarul de coronavirus Wuhan pe teritoriu[25]
ultima actualizare: 9 mai 2020, 18:11 UTC+2
Țară și/sau regiune[a] Cazuri
confirmate
Decese Vindecări
Total 24,011,502 821,909 15,636,116
  Statele Unite 5,899,331 181,791 3,002,904
  Brazilia 3,717,156 117,665 2,908,848
  India 3,310,234 60,472 2,523,771
  Rusia 975,576 16,804 792,561
  Africa de Sud 615,701 13,502 525,242
  Peru 613,378 28,124 421,877
  Mexic 573,888 18,184 396,758
  Columbia 572,270 18,184 407,121
  Spania 419,849 28,971 150,376
  Chile 402,365 10,990 376,298
  Argentina 370,175 7,839 268,788
  Iran 365,606 21,020 314,870
  Regatul Unit 328,848 41,465 fără date
  Arabia Saudită 310,836 3,755 284,945
  Bangladesh 302,147 4,082 190,183
  Pakistan 294,638 6,274 279,561
  Italia 262,540 35,458 206,329
  Turcia 262,507 6,183 239,797
  Franța 253,587 30,544 85,524
  Germania 239,000 9,352 210,597
  Irak 215,784 6,668 157,215
  Filipine 205,581 3,234 133,990
  Indonezia 162,884 7,064 118,575
  Canada 126,228 9,064 112,285
  Qatar 117,742 194 115,558
  Bolivia 112,094 4,726 50,397
  Ucraina 112,059 2,403 54,217
  Ecuador 110,549 6,410 95,097
  Israel 108,964 875 87,011
  Kazahstan 105,075 1,523 93,990
  Egipt 97,825 5,317 68,713
  Republica Dominicană 92,557 5,317 63,478
  Panama 89,082 1,932 63,595
  Suedia 87,072 5,817 fără date
  China 85,004 4,634 80,046
  Oman 84,818 646 79,406
  Belgia 82,447 9,878 18,291
  Kuweit 82,271 521 73,402
  România 81,646 3,421 36,286
  Belarus 70,974 657 69,378
  Guatemala 70,714 2,662 58,783
  Țările de Jos 68,114 6,215 Fără date
  Emiratele Arabe Unite 68,020 378 59,070
  Polonia 64,689 2,010 44,097
  Japonia 64,668 1,226 52,823
  Honduras 56,649 1,747 9,169
  Singapore 56,495 27 54,971
  Portugalia 56,274 1,807 41,184
  Maroc 55,864 984 40,586
  Nigeria 52,800 1,007 39,964
  Bahrain 45,221 725 6,311
  Etiopia 43,769 270 42,048
  Kârgâzstan 43,358 1,057 37,217
  Armenia 43,067 861 36,729
  Algeria 42,619 1,465 29,886
  Venezuela 41,158 343 32.015
  Elveția 40,645 1,723 35,000
  Uzbekistan 40,195 295 36,562
  Afganistan 38,113 1,401 29,037
  Costa Rica 36,307 386 13,317
  Azerbaidjan 35,707 522 33,281
  Moldova 34,982 967 24,156
  Nepal 34,418 175 19,504
  Kenya 33,016 564 19,296
  Serbia 3.029 43 1.218
  Irlanda 3.004 56 2.787
  Austria 2.691 150 1.374
  El Salvador 2.603 104 1.661
  Australia 2.336 10 1.775
  Azerbaidjan 2.279 28 1.576
  Camerun 2.267 108 1.221
  Bolivia 2.266 106 237
  Croația 2.161 86 1,689
  Puerto Rico 2.156 107 746
  Bosnia și Herțegovina 2.070 98 960
  Guinea 2.009 11 663
  Bulgaria 1.911 88 422
  Islanda 1.801 10 1,765
  Honduras 1.771 107 192
  Cuba 1.741 74 1.078
  Estonia 1.725 56 704
  Coasta de Fildeș 1.602 20 754
  Macedonia de Nord 1.586 1 18
  Senegal 1.551 13 611
  Slovacia 1.455 26 905
  Slovenia 1.450 100 252
  Lituania 1.436 49 765
  Noua Zeelandă 1.142 21 1,368
  Djibouti 1.135 3 824
  Sudan 1.111 59 102
  USS Theodore Roosevelt (CVN-71) 1.102 2 53 [26]
  Charles de Gaulle (R91) 1.081 0 0 [27][28]
  Hong Kong 1.045 4 960
  Tunisia 1.030 5 638
  Republica Democrată Congo 937 39 130
  Kârgâzstan 931 12 658
  Letonia 928 18 464
  Somalia 928 44 106
  Guatemala 900 24 101
  Cipru 891 15 400
  Kosovo 862 28 622
  Albania 850 31 620
  Sri Lanka 835 9 240
  Liban 796 26 223
  Niger 795 44 600
  El Salvador 784 16 276
  Costa Rica 773 6 461
  Andorra 752 47 526
  Burkina Faso 744 48 566
  Maldive 744 3 20
 Diamond Princess[b] 712 14 651
  Uruguay 694 18 506
  Mali 668 35 285
  Georgia 626 10 297
  San Marino 623 41 114
  Kenya 621 29 202
  Gabon 620 8 110
  Guineea-Bissau 594 2 0
  Paraguay 61 1 25
  Tajikistan 522 12 510
  Tanzania 509 21 183
  Iordania 508 9 385
  Malta 489 5 419
  Jamaica 490 9 62
  Taiwan 440 6 355
  Guineea Ecuatorială 439 4 13
  Venezuela 388 10 190
  Palestina 375 4 282
  Mauritius 332 10 320
  Insula Man 329 23 271
  Muntenegru 324 8 267
  Jersey 293 25 207
  Vietnam 288 0 241
  Congo 274 10 33
  Rwanda 273 0 136
  Ciad 260 28 50
  Sierra Leone 257 17 54
  Guernsey 252 13 225
  Benin 242 2 62
  Republica Populară Luhansk 232 2 12
  Republica Capului Verde 230 2 44
  São Tomé și Príncipe 208 5 4
  Liberia 199 20 100
  Etiopia 194 4 95
  Madagascar 193 0 101
  Insulele Feroe 187 0 187
  Republica Populară Donețk 180 5 27
  Myanmar 177 6 67
  Zambia 167 4 111
  Eswatini 159 2 12
  Guam 149 5 128
  Costa Atlantica 148 0 0
  Gibraltar 146 0 141
  Haiti 146 12 17
  Togo 145 10 85
  Republica Centrafricană 143 0 10
  Brunei 141 1 131
  Greg Mortimer 128 0 Nu există date
  Cambodgia 122 0 120
  Sudanul de Sud 120 0 0
  Bermuda 118 7 64
  Trinidad și Tobago 116 8 103
  Nepal 109 0 30
  Ciprul de Nord 108 4 103
  Aruba 101 9 89
  Uganda 101 0 55
  Monaco 95 4 82
  Guyana 94 10 35
  Bahamas 92 11 31
  Barbados 83 7 53
  Liechtenstein 82 1 55
  Mozambic 82 0 27
  Insulele Cayman 81 1 41
  MV Artania 81 0 4
  USS Kidd (DDG-100) 78 0 0
  Sint Maarten 76 14 46
  Insulele Virgine Americane 68 4 57
  Libia 64 3 24
  Polinezia Franceză 60 0 56
  Siria 47 3 29
  Macau 45 0 40
  Angola 43 2 11
  Malawi 43 3 14
  Mongolia 42 0 13
  Eritrea 39 0 37
  Yemen 34 7 1
  Zimbabwe 34 4 9
  Antigua și Barbuda 24 3 11
  Timorul de Est 24 0 21
  Botswana 23 1 0
  Grenada 21 0 13
  Gambia 20 1 9
  Laos 19 0 9
  Belize 18 2 16
  Fiji 18 0 14
  Noua Caledonie 18 0 18
  Sfânta Lucia 18 0 17
  Saint Vincent and the Grenadines 17 0 9
  Curaçao 16 1 14
  Dominica 16 0 14
  Namibia 16 0 10
  Nicaragua 16 6 7
  Burundi 15 1 7
  Comunitatea Insulelor Mariane de Nord 15 2 12
  Sfântul Cristofor și Nevis 15 0 13
  Insulele Falkland 13 0 13
  MS Zaandam 14 4 Nu există date
  Coral Princess 12 2 Nu există date
  Insulele Turks și Caicos 12 1 8
  Vatican 12 0 2
  Groenlanda 11 0 11
  Montserrat 11 1 8
  Seychelles 11 0 7
  Arțah 10 0 6
  Suriname 10 1 9
  Comore 8 1 0
  HNLMS Dolfijn 8 0 Nu există date
  Mauritania 8 1 6
  Papua Noua Guinee 8 0 8
  Bhutan 7 0 5
  Insulele Virgine Britanice 7 1 3
  Somaliland 6 0 1
  Abhazia 3 1 2
  Anguilla 3 0 3
  Osetia de Sud 3 0 0
  Bonaire 2 0 2
  Saba 2 0 1
  Sint Eustatius 2 0 2
  Saint Pierre și Miquelon 1 0 0
Note:
  1. ^ Regiunea în care a fost diagnosticat
    cazul. Naționalitatea și locația infecției inițiale pot varia.
  2. ^ Croaziera britanică Diamond Princess se afla în apele japoneze, iar administrația japoneză a fost însărcinată să gestioneze carantina, și pasagerii nu au intrat în Japonia. Prin urmare, cazurile înregistrate pe navă nu sunt incluse între cele numărate de guvernului japonez și de Regatului Unit. Organizația Mondială a Sănătății clasifică cazurile ca fiind localizate „pe un transport internațional”.

EpidemiologieModificare

Drept rezervor pentru acest virus sunt considerate a fi animalele la care au fost expuse persoanele infectate în piața de fructe de mare Huanan[29][30].

Pe 22 ianuarie 2020, Journal of Medical Virology a publicat un raport cu o analiză genomică care reflectă faptul că șerpii în zona Wuhan sunt „cel mai probabil rezervor de animale sălbatice” pentru virus, dar cercetări suplimentare sunt necesare[31][32]. Un eveniment de recombinare omoloagă ar fi putut amesteca un virus „clade A” (virusuri SARS de liliac ca CoVZC45 și CoVZXC21) cu domeniul de legare ARN al unui Beta-CoV încă necunoscut[33][30]. Unii oameni de știință cred că bolile ar putea avea la origine Bungarus multicinctus, un șarpe extrem de veninos găsit în piața Wuhan, unde se vinde ye wei[29].

Unii oameni de știință sunt sceptici cu privire la ipoteza că datele disponibile sugerează că doar mamiferele și păsările pot fi infectate de coronavirusuri[34][35].

O actualizare a unei publicații din 23 ianuarie 2020 pe bioRxiv sugerează că acest coronavirus este posibil a avea liliecii la origine, deoarece analiza efectuată de aceștia arată că nCoV-2019 este în măsură de 96% identic cu un coronavirus de liliac la nivelul întregului genom[36].

EpidemieModificare

Singurul focar cunoscut a fost detectat pentru prima oară în Wuhan, China, spre sfârșitul lunii decembrie 2019. Virusul s-a răspândit ulterior în Bangkok, Tokyo, Seul, Beijing, Shanghai, Guangdong, Dayuan, Hong Kong[37], Macao, statele Washington și Illinois din SUA[38], Vietnam[39], Singapore[40], Melbourne, Australia și Franța (Bordeaux și Paris)[41].

Oamenii de știință de la Medical Research Council's Centre for Global Infectious Disease Analysis de la Imperial College London estimează că până la 4.000 de persoane sunt infectate cu acest coronavirus în orașul Wuhan[31].

Numărul deceselor a ajuns la 305, iar numărul cazurilor a ajuns la 14.642 pe 1 februarie 2020[42].

La sfârșitul lunii ianuarie, acest virus a fost declarat ca fiind o urgență medicală globală de către OMS[43], pe motivul răspândirii acesteia în alte țări decât China, numărului mare de oameni infectați (peste 7.700[44]) și numărului de decese (peste 170[45]).

Vezi șiModificare

Boli cauzate de virusuri genetic similare:

NoteModificare

  1. ^ The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2[*]  Verificați valoarea |titlelink= (ajutor)
  2. ^ „Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV)”. who.int. Accesat în . 
  3. ^ „Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China”. cdc.gov. cdc.gov. . Accesat în . 
  4. ^ Zhang, Y.-Z.; et al. (). „Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome”. Bethesda MD. Accesat în . 
  5. ^ „Pneumonia of unknown cause – China. Disease outbreak news”. World Health Organization. . Arhivat din original la . Accesat în . 
  6. ^ Schnirring, Lisa (). „Report: Thailand's coronavirus patient didn't visit outbreak market”. CIDRAP (în engleză). Arhivat din original la . Accesat în . 
  7. ^ „中国疾病预防控制中心”. chinacdc.cn. Accesat în . 
  8. ^ „New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert”. Accesat în . 
  9. ^ a b „CoV2020”. platform.gisaid.org. Accesat în . 
  10. ^ „Experts explain the latest bulletin of unknown cause of viral pneumonia”. Wuhan Municipal Health Commission. . Arhivat din original la . Accesat în . 
  11. ^ Zhu, Na; Zhang, Dingyu; Wang, Wenling; Li, Xinwang; Yang, Bo; Song, Jingdong; Zhao, Xiang; Huang, Baoying; Shi, Weifeng (). „A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019”. New England Journal of Medicine. 0 (0): null. doi:10.1056/NEJMoa2001017. ISSN 0028-4793. Accesat în . 
  12. ^ „Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses”. nextstrain. Accesat în . 
  13. ^ Trevor Bedford and Richard Neher. „Genomic epidemiology of novel coronavirus (nCoV) using data generated by Fudan University, China CDC, Chinese Academy of Medical Sciences, Chinese Academy of Sciences, Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention and the Thai National Institute of Health shared via GISAID”. nextstrain.org. Accesat în . 
  14. ^ „Initial genome release of novel coronavirus”. Virological. . Accesat în . 
  15. ^ „Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome”. ncbi.nlm.nih.gov. . 
  16. ^ Gruber, Christian; Steinkellner, Georg (). „Wuhan coronavirus 2019-nCoV - what we can find out on a structural bioinformatics level”. Innophore Enzyme Discovery. Innophore GmbH. 
  17. ^ „Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission”. SCIENCE CHINA Life Sciences. doi:10.1007/s11427-020-1637-5 (inactiv ). Accesat în . 
  18. ^ Gralinski, Lisa E.; Menachery, Vineet D. (). „Return of the Coronavirus: 2019-nCoV”. Viruses (în engleză). 12 (2): 135. doi:10.3390/v12020135. Accesat în . 
  19. ^ Letko, Michael; Munster, Vincent (). „Functional assessment of cell entry and receptor usage for lineage B β-coronaviruses, including 2019-nCoV”. BiorXiv (în engleză). doi:10.1101/2020.01.22.915660. Accesat în . 
  20. ^ Zhou, Peng; Shi, Zheng-Li (). „Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin”. BiorXiv (în engleză). doi:10.1101/2020.01.22.914952. Accesat în . 
  21. ^ Mandelbaum RF (). „Scientists Create Atomic-Level Image of the New Coronavirus's Potential Achilles Heel”. Gizmodo. Accesat în . 
  22. ^ Wrapp D, Wang N, Corbett KS, et al. (februarie 2020). „Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation”. Science: eabb2507. doi:10.1126/science.abb2507. PMID 32075877 Verificați valoarea |pmid= (ajutor). 
  23. ^ „China confirms human-to-human transmission of new coronavirus”. CBC News. . Accesat în . 
  24. ^ „WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide”. Reuters. . Accesat în . 
  25. ^ „Coronavirus Toll Update: Cases & Deaths by Country of Wuhan, China Virus - Worldometer”. www.worldometers.info (în engleză). Accesat în . 
  26. ^ „U.S. Navy COVID-19 Updates”. Navy Live (în engleză). . Accesat în . 
  27. ^ „Coronavirus : près de 700 marins positifs au Covid-19, la majorité sur le porte-avions Charles de Gaulle”. francebleu.fr. . 
  28. ^ „Twenty sailors hospitalised after Covid-19 hits French aircraft carrier”. RFI. . 
  29. ^ a b SCIMEX (). „EXPERT REACTION: Could new coronavirus have come from snakes?”. Scimex. Accesat în . 
  30. ^ a b Haitao Guo; Guangxiang "George" Luo; Shou-Jiang Gao (). „Snakes could be the original source of the new coronavirus outbreak in China”. The Conversation. Accesat în . 
  31. ^ a b BBC: China coronavirus: Fear grips Wuhan as lockdown begins
  32. ^ CNN: Snakes could be the source of the Wuhan coronavirus outbreak
  33. ^ Ji, Wei; Wang, Wei; Zhao, Xiaofang; Zai, Junjie; Li, Xingguang (). „Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human”. Journal of Medical Virology. doi:10.1002/jmv.25682. PMID 31967321. 
  34. ^ https://www.wired.com/story/wuhan-coronavirus-snake-flu-theory/
  35. ^ Ewen Callaway, David Cyranoski (). „Why snakes probably aren't spreading the new China virus”. Nature. doi:10.1038/d41586-020-00180-8. 
  36. ^ „Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin”. bioRxiv. bioRxiv. . Accesat în . 
  37. ^ „China coronavirus: Hong Kong widens criteria for suspected cases after second patient confirmed, as MTR cancels Wuhan train ticket sales”. South China Morning Post. . Accesat în . 
  38. ^ „China Virus Spreads to U.S. With Health Officials on High Alert”. Bloomberg L.P. . Accesat în . 
  39. ^ hermesauto (). „Wuhan virus: Vietnam confirms 2 cases of Sars-like coronavirus”. The Straits Times. Accesat în . 
  40. ^ hermesauto (). „Singapore confirms first case of Wuhan virus”. The Straits Times (în engleză). Accesat în . 
  41. ^ „Coronavirus: China extends lockdown as first cases reported in Europe”. The Guardian (în engleză). . Accesat în . 
  42. ^ „Coronavirus - Worldometer” (în engleză). . Accesat în . 
  43. ^ „Coronavirus declared global health emergency by WHO”. BBC News (în engleză). . Accesat în . 
  44. ^ „More Than 7,700 Cases of Coronavirus Recorded Worldwide”. The New York Times (în engleză). . Accesat în . 
  45. ^ „Coronavirus: Death toll rises as virus spreads to every Chinese region”. BBC News (în engleză). . Accesat în . 

Legături externeModificare