Entrez

Sistemul Entrez de căutare globală prin interogarea a multiple baze de date este un motor de căutare integrativ, sau portal internet, care permite utilizatorilor să caute în numeroase baze de date din domeniul științelor sănătății, al Centrului Național pentru informații biotehnologice (NCBI).^[1] NCBI aparține Bibliotecii Naționale de Medicină din SUA (NLM), care este un departament al Institutelor Naționale de Sănătate (NIH), parte a Departamentului de Sănătate și Servicii Umane al SUA. Denumirea „Entrez” (însemnând „Intrați!” în limba franceză) a fost aleasă pentru a reflecta faptul că publicul este bine-venit să caute conținutul pus la dispoziție de către biblioteca NLM.

Sistemul Entrez de interogare globală este un sistem integrat de căutare și redare, care furnizează acces simultan la toate bazele de date. Acesta poate găsi secvențe (structuri biomoleculare primare), structuri (structuri biomoleculare terțiare) și referințe. Sistemul Entrez poate furniza diagrame ale genelor și secvențelor proteice, precum și hărți cromozomale.

Baze de date

Entrez caută în următoarele baze de date:

PubMed: abstracte și citări din literatura biomedicală, inclusiv din Medline - articole (majoritatea jurnale științifice medicale).
PubMed Central: articole de jurnal gratuite
Căutare în sit: siturile NCBI web și FTP
Cărți: cărți electronice
Succesiunea mendeliană la om (OMIM)
Nucleotide: baza de date cu secvențe (GenBank)
Proteine: bază de date cu secvențe
Genom: secvențe de genom complete și identificare
Structuri: structuri macromoleculare tridimensionale
Taxonomie: organisme din taxonomia GenBank
SNP: polimorfisme uninucleotidice
Gene:^[2] informații despre gene
HomoloGene: grupuri de omologie eucariotică
Compuși din PubChem: structuri chimice micro-moleculare unice
Substanțe din PubChem: înregistrări de substanțe chimice depuse
Proiectul Genomului: informații din proiectul genomului
UniGene: grupări genetice de secvențe de transcripție
CDD: baza de date cu domenii proteice conservate
PopSet: seturi de date din studii populaționale (epidemiologie)
Profile GEO: profile de exprimare și abundență moleculară
Seturi de date GEO: seturi experimentale de date GEO
Arhivă de citire secvențe: date de secvențiere
Cromozomii cancerului: baze de date citogenetice
PubChem BioAssay: monitorizări ale bioactivității substanțelor chimice
Probe: reactivi specifici secvențelor
Catalog NLM: date bibliografice NLM pentru mai mult de 1,2 milioane resurse de tip jurnale, cărți, producții audio-video, programe de calculator, resurse electronice și alte materiale din LocatorPlus (actualizat zilnic).

Istorie

În anul 1991, Entrez a fost lansat sub formă unui CD. În anul 1993, o versiune client-server asigura legătura prin internet. În anul 1994, NCBI a lansat un sit web în care a fost inclus Entrez. În anul 2001, a fost lansat raftul pentru Entrez, iar în anul 2003, a fost elaborată baza de date Entrez Gene.^[3]

Note

^ Coordonatorii resurselor NCBI (2012). „Bazele de date resursă ale Centrului Național pentru informații biotehnologice”. Cercetarea Acizilor Nucleici (en.). 41 (Prima ediție): D8–D20. doi:10.1093/nar/gks1189. PMID 23193264.
^ „Gene - NCBI”.
^ Smith, Kent. „Un scurt istoric al formării și creșterii NCBI”. Manualul NCBI [Internet]. Ediția a 2-a (en.). Accesat în 31 mai 2018.

Legături externe

Formularul de căutare Entrez (en.)

[1] Coordonatorii resurselor NCBI (2012). „Bazele de date resursă ale Centrului Național pentru informații biotehnologice”. Cercetarea Acizilor Nucleici (en.). 41 (Prima ediție): D8–D20. doi:10.1093/nar/gks1189. PMID 23193264.

[2] „Gene - NCBI”.

[3] Smith, Kent. „Un scurt istoric al formării și creșterii NCBI”. Manualul NCBI [Internet]. Ediția a 2-a (en.). Accesat în 31 mai 2018.

[1]

[2]

[3]