Format:Infocaseta Proteină/doc

Aceasta este pagina de documentație pentru Format:Infocaseta Proteină. Pagina descrie modul de folosire al formatului și conține categoriile de care acesta aparține, precum și orice altceva ce nu face parte din formatul propriu-zis.

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

Usage

To use this template, copy the following text and paste it at the top of your article. Fill in as many fields as possible, but don't worry if some information is missing.

{{Infobox protein family
| class = <!-- to save space: collapsible collapsed -->
| Symbol = 
| Name = 
| image = 
| caption = 
| Pfam = 
| Pfam_clan = 
| InterPro = 
| SMART = 
| PROSITE = 
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP = 
| TCDB = 
| OPM family = 
| OPM protein = 
| CAZy = 
| CDD =
| Membranome superfamily =
| Membranome family =
}}

Examples

The following filled in Pfam infobox template produces the information box to the right.

Ligand-binding domain (LBD)
RORγ (PDB: 3L0L​)
Identificatori
Symbol	Hormone_recep
Pfam	PF00104
InterPro	IPR000536
SMART	SM00430
CATH	1lbd
SCOP2	1lbd / SCOPe / SUPFAM
CDD	cd06157
Available protein structures: Pfam   structures / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum structure summary

{{Infobox protein family
| Symbol = Hormone_recep
| class = collapsible
| Name = Ligand-binding domain (LBD)
| image = RORC_3L0L.png
| caption = [[RAR-related orphan receptor gamma|RORγ]] ({{PDB|3L0L}})
| Pfam = PF00104
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE = 
| SCOP = 1lbd
| CATH = 1lbd
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd06157
}}

Maintenance

• Category:Protein pages needing a picture

TemplateData

Aceasta este documentația TemplateData pentru format folosită de Editorul vizual și alte unelte.

Infocaseta Proteină

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

Parametrii formatului

Parametru		Descriere	Tip	Stare
Symbol	Symbol	fără descriere	Linie	opțional
Name	Name	fără descriere	Linie	opțional
Image	image	fill in "NONE" if not needed to suppress the tracking category	Fișier	opțional
Width	width	Width for image	Șir	opțional
Caption	caption	Caption for image	Șir	opțional
InterPro family identifier	InterPro	fără descriere	Unknown	opțional
Pfam family identifier	Pfam	Auto-links to Pfam family record	Linie	opțional
Pfam clan identifier	Pfam_clan	Auto-links to Pfam clan record; a clan is a group of related families (~superfamily).	Linie	opțional
Interpro identifier	Interpro	Auto-links to an Interpro entry	Linie	opțional
SMART accession number	SMART	Auto-links to a domain entry in the Simple Modular Architecture Research Tool	Linie	opțional
PROSITE record identifier	PROSITE	Auto-links to a PROSITE record search	Linie	opțional
MEROPS record identifier	MEROPS	Auto-links to a MEROPS record (MEROPS is scoped to peptidases and their inhibitors)	Linie	opțional
SCOP (domain/PDB accession number)	SCOP	Given a PDB accession number or SCOP domain name, auto-links to a SCOP and a SUPFAMpage.	Linie	opțional
SCOP2 override	SCOP2	SCOP and SCOP2 use different domain nomenclature. Use this value if a domain is specified for SCOP. Exemplu 8029676	Unknown	opțional
CATH (domain/PDB accession number)	CATH	Given a CATH domain ID or a PDB accession number, auto-links to CATH (Classification of Protein Structural Domains).	Linie	opțional
TCDB identifier	TCDB	Auto-links to an identifier search in the Transporter Classification Database	Linie	opțional
OPM superfamily identifier	OPM family	Auto-links to a superfamily record in the database of Orientations of Proteins in Membranes.	Linie	opțional
OPM protein identifier	OPM protein	Value will typically be a PDB identifier; auto-links to a protein record in the database of Orientations of Proteins in Membranes	Linie	opțional
CAZy family identifier	CAZy	Auto-links to a family description page in the database of Carbohydrate-Active enZYmes.	Linie	opțional
CDD uid	CDD	Auto-links to a record in the Conserved Domain Database	Linie	opțional
align	align	fără descriere	Unknown	opțional
image_size	image_size	fără descriere	Unknown	opțional
alt	alt	fără descriere	Unknown	opțional
Membranome superfamily	Membranome superfamily	fără descriere	Unknown	opțional
Membranome family	Membranome family	fără descriere	Unknown	opțional
class	class	infobox class Exemplu collapsible collapsed	Unknown	opțional
below	below	footnotes	Unknown	opțional
PDB	PDB	PDB examples. Only use if all of: no image is available, no CATH/SCOP examples, InterPro or PDB search fails.	Conținut	învechit

Descriere scurtă a formatului și a scopului său.

Format de bază

Codul formatului, schematic, punând în evidență cei mai utilizați parametri.

Parametri

Descrierea completă a tuturor parametrilor, în cazul în care formatul are parametri.

Mod de folosire

Dacă trebuie urmați anumiți pași pentru a utiliza formatul, explicați procedura.

Exemple

Dați câteva exemple ale modului de folosire, folosind cod și exemple.

Codul exemplului 1

Codul exemplului 2

Detalii tehnice

Dacă formatul este mai complex, puteți da detalii despre modul în care este construit. Acestea pot fi utile utilizatorilor care vor să îmbunătățească formatul.

Vezi și

• legături
• spre alte
• formate
• sau pagini