Metabolomică

Metabolomica este un domeniu științific care se ocupă cu studiul proceselor chimice care includ metaboliții, moleculele mici care acționează ca substrat, intermediari de reacție și produși ai metabolismului celular. În mod specific, metabolomica este „studiul sistematic al amprentelor chimice unice pe care procesele celulare specifice le lasă” și studiul profilului metaboliților, ca molecule de dimensiune mică.^[1] Metabolomul reprezintă totalitatea metaboliților dintr-o celulă, țesut, organ sau organism, aceștia fiind produșii finali ai proceselor celulare.^[2] Analiza ARN-ului mesager (ARNm), datelor legate de expresia genelor și proteomica scot la iveală un set de produși genetici celulari. În schimb, profilul metabolic are rolul de a indica o vedere de ansamblu instantanee asupra fiziologiei celulare,^[3] și astfel metabolomica prezintă în mod direct starea fiziologică a unui organism.^[4] Există metode de corelații cuantificabile între metabolom și alte structuri celulare (genom, transcriptom, proteom și lipidom), iar acestea pot fi utilizate pentru a prezice răspândirea metaboliților în probe biologice, de exemplu abundența ARNm.^[5]

Note

^ Daviss, Bennett (aprilie 2005). „Growing pains for metabolomics”. The Scientist. 19 (8): 25–28.
^ Jordan KW, Nordenstam J, Lauwers GY, Rothenberger DA, Alavi K, Garwood M, Cheng LL (martie 2009). „Metabolomic characterization of human rectal adenocarcinoma with intact tissue magnetic resonance spectroscopy”. Diseases of the Colon and Rectum. 52 (3): 520–5. doi:10.1007/DCR.0b013e31819c9a2c. PMC 2720561  . PMID 19333056.
^ Villate, Aitor; Nicolas, Markel San; Gallastegi, Mara; Aulas, Pierre-Antoine; Olivares, Maitane; Usobiaga, Aresatz; Etxebarria, Nestor; Aizpurua-Olaizola, Oier (9 decembrie 2020). „Review: Metabolomics as a prediction tool for plants performance under environmental stress”. Plant Science (în engleză). 303: 110789. doi:10.1016/j.plantsci.2020.110789. ISSN 0168-9452. PMID 33487364.
^ Hollywood K, Brison DR, Goodacre R (septembrie 2006). „Metabolomics: current technologies and future trends”. Proteomics. 6 (17): 4716–23. doi:10.1002/pmic.200600106. PMID 16888765.
^ Cavicchioli, Maria Vittoria; Santorsola, Mariangela; Balboni, Nicola; Mercatelli, Daniele; Giorgi, Federico Manuel (ianuarie 2022). „Prediction of Metabolic Profiles from Transcriptomics Data in Human Cancer Cell Lines”. International Journal of Molecular Sciences (în engleză). 23 (7): 3867. doi:10.3390/ijms23073867  . ISSN 1422-0067. PMID 35409231 Verificați valoarea |pmid= (ajutor).

Vezi și

[1] Daviss, Bennett (aprilie 2005). „Growing pains for metabolomics”. The Scientist. 19 (8): 25–28.

[2] Jordan KW, Nordenstam J, Lauwers GY, Rothenberger DA, Alavi K, Garwood M, Cheng LL (martie 2009). „Metabolomic characterization of human rectal adenocarcinoma with intact tissue magnetic resonance spectroscopy”. Diseases of the Colon and Rectum. 52 (3): 520–5. doi:10.1007/DCR.0b013e31819c9a2c. PMC 2720561  . PMID 19333056.

[:5-3] Villate, Aitor; Nicolas, Markel San; Gallastegi, Mara; Aulas, Pierre-Antoine; Olivares, Maitane; Usobiaga, Aresatz; Etxebarria, Nestor; Aizpurua-Olaizola, Oier (9 decembrie 2020). „Review: Metabolomics as a prediction tool for plants performance under environmental stress”. Plant Science (în engleză). 303: 110789. doi:10.1016/j.plantsci.2020.110789. ISSN 0168-9452. PMID 33487364.

[Hollywood_2006-4] Hollywood K, Brison DR, Goodacre R (septembrie 2006). „Metabolomics: current technologies and future trends”. Proteomics. 6 (17): 4716–23. doi:10.1002/pmic.200600106. PMID 16888765.

[5] Cavicchioli, Maria Vittoria; Santorsola, Mariangela; Balboni, Nicola; Mercatelli, Daniele; Giorgi, Federico Manuel (ianuarie 2022). „Prediction of Metabolic Profiles from Transcriptomics Data in Human Cancer Cell Lines”. International Journal of Molecular Sciences (în engleză). 23 (7): 3867. doi:10.3390/ijms23073867  . ISSN 1422-0067. PMID 35409231 Verificați valoarea |pmid= (ajutor).

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]