Arheologia, ca orice alt domeniu științific, se imparte în mai multe subdomenii în funcție de tipul de studiu specific.

În funcție de zona geografică studiată sau de zona geografică într-o anumită perioadă distingem:

În cea ce privește perioada studiată, arheologia se împarte în mai multe domenii. Pentru România, principalel sub-domenii studiate sunt:

Alte sub-domenii din aceasta categorie nu sunt specifice cercetării românești:

Alte sub-discipline ale arheologiei nu se studiază în mod separat dar sunt metode folosite în marile proiecte arheologice, mai ales metode utilizate de alte științe:

  • Arheologie aeriană - utilizează fotografia aeriana și din satelit.
  • Arheometrie - utilizează metode ale fizicii prin identificarea unor structuri în sol datorită modificărilor în câmpul magnetic al Pământului.
  • Arheozoologie - medode ale zoologiei în identificarea resturilor de faună în siturile arheologice
  • Arheobotanica sau paleobotanica - studiază pe baza botanicii resturile de vegetație în siturile arheologice
  • Arheologie experimentală - se folosește în cadrul unor proiecte de reconstruire a habitatului, a tehnologiei sau a modului de viață.
  • Arheologie subacvatică - se ocupă cu studiul siturilor arheologice aflate sub apă cu ajutorul scafandrilor.
  • Etnoarheologie - studiază societatea modernă și face legături cu civilizațiile unor epoci mai vechi.
  • Arheologie urbană - arheologia orașelor, se referă in general la epoci mai noi începând cu evul mediu
  • Arheologie subterană - sau arheospeologie, studiază urmele civilizației umane rămase în peșteri, utilizând metode ale speologiei.