Format:Infocaseta Proteină
Infocaseta Proteină | |
Identificatori | |
---|---|
Symbol | ? |
Documentație format
Această documentație este adusă de la pagina Format:Infocaseta Proteină/doc.
|
[lectură]
[modificare]
[istoric] |
This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.
Usage
To use this template, copy the following text and paste it at the top of your article. Fill in as many fields as possible, but don't worry if some information is missing.
{{Infobox protein family | class = <!-- to save space: collapsible collapsed --> | Symbol = | Name = | image = | caption = | Pfam = | Pfam_clan = | InterPro = | SMART = | PROSITE = | MEROPS = | CATH = | SCOP = | TCDB = | OPM family = | OPM protein = | CAZy = | CDD = | Membranome superfamily = | Membranome family = }}
Examples
The following filled in Pfam infobox template produces the information box to the right.
Ligand-binding domain (LBD) | |||||||||
RORγ (PDB: 3L0L) | |||||||||
Identificatori | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Symbol | Hormone_recep | ||||||||
Pfam | PF00104 | ||||||||
InterPro | IPR000536 | ||||||||
SMART | SM00430 | ||||||||
CATH | 1lbd | ||||||||
SCOP2 | 1lbd / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd06157 | ||||||||
|
{{Infobox protein family | Symbol = Hormone_recep | class = collapsible | Name = Ligand-binding domain (LBD) | image = RORC_3L0L.png | caption = [[RAR-related orphan receptor gamma|RORγ]] ({{PDB|3L0L}}) | Pfam = PF00104 | InterPro = IPR000536 | SMART = SM00430 | PROSITE = | SCOP = 1lbd | CATH = 1lbd | TCDB = | OPM family = | OPM protein = | CDD = cd06157 }}
Maintenance
TemplateData
Infocaseta Proteină
This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.
Parametru | Descriere | Tip | Stare | |
---|---|---|---|---|
Symbol | Symbol | fără descriere | Linie | opțional |
Name | Name | fără descriere | Linie | opțional |
Image | image | fill in "NONE" if not needed to suppress the tracking category | Fișier | opțional |
Width | width | Width for image | Șir | opțional |
Caption | caption | Caption for image | Șir | opțional |
InterPro family identifier | InterPro | fără descriere | Unknown | opțional |
Pfam family identifier | Pfam | Auto-links to Pfam family record | Linie | opțional |
Pfam clan identifier | Pfam_clan | Auto-links to Pfam clan record; a clan is a group of related families (~superfamily). | Linie | opțional |
Interpro identifier | Interpro | Auto-links to an Interpro entry | Linie | opțional |
SMART accession number | SMART | Auto-links to a domain entry in the Simple Modular Architecture Research Tool | Linie | opțional |
PROSITE record identifier | PROSITE | Auto-links to a PROSITE record search | Linie | opțional |
MEROPS record identifier | MEROPS | Auto-links to a MEROPS record (MEROPS is scoped to peptidases and their inhibitors) | Linie | opțional |
SCOP (domain/PDB accession number) | SCOP | Given a PDB accession number or SCOP domain name, auto-links to a SCOP and a SUPFAMpage. | Linie | opțional |
SCOP2 override | SCOP2 | SCOP and SCOP2 use different domain nomenclature. Use this value if a domain is specified for SCOP.
| Unknown | opțional |
CATH (domain/PDB accession number) | CATH | Given a CATH domain ID or a PDB accession number, auto-links to CATH (Classification of Protein Structural Domains). | Linie | opțional |
TCDB identifier | TCDB | Auto-links to an identifier search in the Transporter Classification Database | Linie | opțional |
OPM superfamily identifier | OPM family | Auto-links to a superfamily record in the database of Orientations of Proteins in Membranes. | Linie | opțional |
OPM protein identifier | OPM protein | Value will typically be a PDB identifier; auto-links to a protein record in the database of Orientations of Proteins in Membranes | Linie | opțional |
CAZy family identifier | CAZy | Auto-links to a family description page in the database of Carbohydrate-Active enZYmes. | Linie | opțional |
CDD uid | CDD | Auto-links to a record in the Conserved Domain Database | Linie | opțional |
align | align | fără descriere | Unknown | opțional |
image_size | image_size | fără descriere | Unknown | opțional |
alt | alt | fără descriere | Unknown | opțional |
Membranome superfamily | Membranome superfamily | fără descriere | Unknown | opțional |
Membranome family | Membranome family | fără descriere | Unknown | opțional |
class | class | infobox class
| Unknown | opțional |
below | below | footnotes | Unknown | opțional |
PDB | PDB | PDB examples. Only use if all of: no image is available, no CATH/SCOP examples, InterPro or PDB search fails. | Conținut | învechit |
Descriere scurtă a formatului și a scopului său.
Format de bază
Codul formatului, schematic, punând în evidență cei mai utilizați parametri.
Parametri
Descrierea completă a tuturor parametrilor, în cazul în care formatul are parametri.
Mod de folosire
Dacă trebuie urmați anumiți pași pentru a utiliza formatul, explicați procedura.
Exemple
Dați câteva exemple ale modului de folosire, folosind cod și exemple.
Codul exemplului 1
Format:Formatul care demonstrează exemplul 1
Codul exemplului 2
Format:Formatul care demonstrează exemplul 2
Detalii tehnice
Dacă formatul este mai complex, puteți da detalii despre modul în care este construit. Acestea pot fi utile utilizatorilor care vor să îmbunătățească formatul.
Vezi și
- legături
- spre alte
- formate
- sau pagini