Sezonul 2008-09 a fost cel de-al 60-lea pentru Dinamo . În acest sezon, Dinamo a jucat în Liga I , Cupa României și în Europa League .
În vara lui 2008, Mircea Rednic a revenit pe banca lui Dinamo cu obiectivele următoare: campionatul și calificarea în grupele Europa League . Turul a fost dezamăgitor, jucând meciuri modeste cu celelalte candidate la titlu: Rapidul , CFR-ul sau cu Urziceniul , dar au reușit să bată contracandidata directă la titlu, FC Timișoara , cu 3-0 în deplasare. Dinamo a fost atunci campioana de iarnă după ce Urziceniul a pierdut cu rivalii de la Steaua .
Începutul returului a fost foarte promițător: au bătut Rapidul în 2 rânduri: o dată acasă cu 3-0 în campionat, o dată în Cupa României cu 4-2, dar s-a terminat însă foarte prost: au fost învinși în ultimele 3 meciuri ale campionatului de Unirea Urziceni , FC Brașov și de FC Argeș , trimițând echipa pe ultimul loc de pe podium.
Ionel Dănciulescu , golgeterul lui Dinamo din 2008-09 alături de Marius Niculae
Liga I
Runda
Data/Timpul
Oponent
Stadion
Scor
Marcatori (Minute)
I
27.07/21:15
Pandurii Târgu Jiu
A
1–1
Torje (55)
II
03.08/20:30
Gaz Metan Mediaș
H
1–0
Bratu (27)
III
10.08/20:00
CS Otopeni
A
3–2
Nyema (o.g. 9), Bratu (45), Niculae (85)
IV
16.08/21:45
Gloria Buzău
H
4–1
Dănciulescu (8, 44), Diogo da Silva (o.g. 48), Bratu (74)
V
24.08/20:45
Rapid București
A
1–2
Bratu (70)
VI
30.08/20:45
Univ. Craiova
H
1–0
Niculae (52)
VII
13.09/19:00
FC Vaslui
A
2–1
Dănciulescu (61), Bratu (90)
VIII
22.09/21:00
Poli Iași
H
2–0
Bratu (46, 61)
IX
26.09/16:30
Gloria Bistrița
A
2–1
Dănciulescu (12, 33)
X
05.10/19:00
FC Farul Constanța
H
1–0
An.Cristea (48)
XI
17.10/20:45
CFR Cluj
A
0–1
XII
25.10/20:45
Oțelul Galați
H
1–0
Torje (60)
XIII
01.11/21:00
Steaua București
H
1–1
Ad. Cristea (84)
XIV
08.11/20:30
FC Timișoara
A
3–0
Brezinsky (o.g. 12), Dănciulescu (52), An. Cristea (67)
XV
16.11/21:00
Unirea Urziceni
H
0–1
XVI
22.11/14:00
FC Brașov
A
0–2
XVII
29.11/20:00
FC Argeș
H
2–0
Ad. Cristea (65), Miranda (90)
XVIII
01.03/20:30
Pandurii Târgu Jiu
H
3–0
Niculae (2), Niculescu (29), Zicu (90)
XIX
07.03/15:00
Gaz Metan Mediaș
A
1–1
N'Doye (18)
XX
15.03/18:00
CS Otopeni
H
0–0
XXI
22.03/17:00
Gloria Buzău
A
3–1
Niculescu (12), Niculae (30), Dănciulescu (57)
XXII
04.04/21:00
Rapid București
H
3–0
Dănciulescu (29), Niculae (56), Ad.Cristea (89)
XXIII
08.04/21:00
Univ. Craiova
A
0–2
XXIV
11.04/20:30
FC Vaslui
H
4–1
Niculae (24, 78, 90) Zicu (87)
XXV
18.04/16:00
Poli Iași
A
0–1
XXVI
21.04/17:00
Gloria Bistrița
H
5–0
Niculae (20, 56, 73), Miranda (84), Dănciulescu (90)
XXVII
24.04/18:00
Farul Constanța
A
4–1
Ad.Cristea (38), Dănciulescu (40), Torje (53), Niculescu (80)
XXVIII
02.05/21:00
CFR Cluj
H
1–0
Dănciulescu (44)
XXIX
05.05/16:00
Oțelul Galați
A
1–0
Dănciulescu (34)
XXX
08.05/21:00
Steaua București
A
1–1
Niculescu (88)
XXXI
17.05/20:30
FC Timișoara
H
3–1
N'Doye (39, 49), Niculae (45)
XXXII
24.05/20:30
Unirea Urziceni
A
0–1
XXXIII
31.05/20:30
FC Brașov
H
0–2
XXXIV
10.06/20:00
FC Argeș
A
2–5
Zicu (31), Niculescu (90)
NEC câștigă cu 1-0 la total.
Fundași (apariții/goluri): George Blay (17/0), Zie Diabaté (8/0), Lucian Goian (20/0), Dragoș Grigore (2/0), Sergiu Homei (10/0), Silviu Izvoranu (17/0), Júlio César (10/0), Cosmin Moți (21/0), Nicolae Mușat (1/0), Cristian Pulhac (10/0), Adrian Scarlatache (12/0), Bruno Simão (10/0), Gabriel Tamaș (22/0) Mijlocași (apariții/goluri): Anoh Attoukora (1/0), Papa Malick Ba (9/0), Gabriel Boștină (26/0), Gualberto Campos (2/0), Adrian Cristea (32/4), Mourtala Diakité (6/0), Nicolae Mitea (12/0), Ousmane N'Doye (12/3), Adrian Ropotan (15/0), Thiago (6/0), Gabriel Torje (30/3), Vojislav Vranjković (4/0), Zé Kalanga (10/0) 
Mircea Rednic
NEC
58'