Institutul Sanger
| Institutul Sanger al Trustului Wellcome | |
 | |
| Informații | |
|---|---|
| Fondată | 1992 |
| Localizare | |
| Țara | .svg){kind=small} Regatul Unit |
South Cambridgeshire  | |
| Oraș | Hinxton |
| Coordonate | 52°04′39″N 0°11′15″E / 52.0775°N 0.1875°E |
| Campus | Wellcome Trust Genome Campus |
| Conducere | |
| Director | Professor Sir Michael Stratton |
| Cifre cheie | |
| Angajați | 900 |
| Corp didactic | 37 |
| Cercetători | ~900 |
| Alte informații | |
| Afiliere | Universitatea Cambridge |
| Prezență web | |
| www.sanger.ac.uk | |
Modifică date / text  | |
Institutul Sanger, aparținând Trustului Wellcome este o organizație britanică non-profit, axată pe cercetarea în domeniul geneticii. A fost fondată de Trustul Wellcome.[1]
Institutul Sanger se află în Wellcome Trust Genome Campus, lângă satul Hinxton, în apropiere de Cambridge, Marea Britanie. În același campus se află și Institutul European de Bioinformatică. A fost înființat în 1992 sub numele de Centrul Sanger, numit așa după dublul laureat al premiului Nobel Frederick Sanger.[2][3] A fost inițial un centru de dimensiuni mari dedicat secvențierii ADN și a participat în Proiectul „Genomul uman”.
Institutul Sanger a avut cea mai mare contribuție unitară la secvențierea genomului uman. De la înființarea sa, institutul duce o politică de data sharing, iar majoritatea proiectelor de cercetare sunt făcute în colaborare cu alte instituții.
Începând cu anul 2000, institutul are ca misiune și înțelegerea rolului geneticii în stările de sănătate și boală.[4] Institutul are în prezent aproximativ 900 de angajați, care lucrează în patru mari arii de studiu: genetica umană, genetica agenților patogeni, genetica șoarecilor și bioinformatica.
Facililități și resurse
modificareCampus
modificare
"Campusul ADN-ului" (Genome campus) al Trustului Wellcome are aproximativ 1300 de angajați, 900 lucrând pentru Institutul Sanger, iar restul lucrând în Institutul European de Bioinformatică și alte companii mai mici.
Secvențiere
modificareAngajații Institutului Sanger lucrează săptămânal cu milioane de mostre de ADN. Institutul folosește tehnologie de ultimă oră pentru a răspunde la întrebări care până acum câțiva ani nu aveau răspuns. [5] Datorită progreselor tehnologiei, Institutul Sanger secvențiază genomurile oamenilor, a altor specii vertebrate și a agenților patogeni, în ritm tot mai mare, și la prețuri tot mai mici. Institutul Sanger secvențiază aproximatix 10 miliarde de baze azotate în fiecare zi. [6]
Resurse științifice
modificarePrincipalele rezultate ale programelor de cercetare de la Institutul Sanger sunt bazele de date care conțin informații din biologie. Bazele de date întreținute de Institutul Sanger sunt:
- COSMIC,[7] un catalog al mutațiilor somatice ale cancerului
- DECIPHER,[8] o bază de date a dezechilibrelor cromozomiale ale oamenilor, folosind resurse Ensembl
- Ensembl,[9] un browser de genomuri, găzduit împreună cu Institutul European de Bioinformatică
- GeneDB,[10] o bază de date dedicată agenților patogeni
- MEROPS,[11] bază de date a peptidazelor
- Mouse Genetics Project, o bază de date care conține analiza fenotipică a sute de șoareci mutanți
- Pfam,[12] o bază de date dedicată famiilor de proteine
- Rfam,[13] o bază de date dedicată famiilor de ARN
- TreeFam,[14] o bază de date a arborilor filogenetici a genelor animale
- Vega,[15] o unealtă pentru anotarea genomurilor animalelor vertebrate
- WormBase,[16] o bază de date dedicată c C. elegans și altor viermi
Cercetare
modificare
Începând cu anul 2000, Institutul Sanger a investit în secvențiere și a creat noi programe pentru biologia postgenomică - înțelegerea mesajelor din gene . Institutul este implicat în diferite arii de cercetare:
Genetica umană
modificareInstitutul se axează pe caracterizarea variației genetice a oamenilor. Pe lângă contribuția la Proiectul „Genomul uman”, cercetătorii de la Institutul Sanger au contribuit la diverse studii legate de îmbolnăvire, genetică comparativă și genetică evolutivă. În ianuarie 2008, lansarea Proiectului celor 1000 de genomuri , proiect la care au colaborat cercetători din toată lumea, a semnalat efortul de a secvenția 1000 de indivizi cu scopul de a crea "cea mai detaliată hartă a variației genetice cu scopul de a înțelege studiile despre îmbolnăvire" .[17] Datele rezultate din proiectele-pilot sunt accesibile gratuit începând cu iunie 2010. [18] În anul 2010, Institutul Sanger și-a anunțat participarea la proiectul UK10K ,[19][20][21] care are ca scop secvențierea genomurilor a 10.000 de indivizi, pentru a identifica variații genetice rare și efectele lor asupra sănătății oamenilor. Institutul Sanger este de asemenea membru al International Cancer Genome Consortium, un proiect internațional care are ca scop descrierea diferitelor tipuri de tumori. [22] De asemenea, Institutul Sanger este membru al programelor de cercetare GENCODE și ENCODE [23] care au ca scop crearea unei enciclopedii a elementelor ADN. [necesită citare]
Organisme de referință
modificareProgramele dedicate geneticii șoarecilor și peștilor folosesc secvențele ADN ale acestor organisme de referință pentru a înțelege mecanisme biologice elementare și funcțiile genelor umane. Proiectele includ studiul dezvoltării, cancerului și comportamentului.
Genetica organismelor patogene
modificareInstitutul studiază efectele variației genetice în interactiunea dintre gazdă și organismele patogene. Cercetarea de la Institutul Sanger include multe bacterii, viruși și alte organisme patogene.
Bioinformatică
modificareEchipele de bioinformatică de la Institutul Sanger au dezvoltat sisteme IT pentru secvențiere în cercetarea postgenomică. Institutul dezvoltă și menține unelte informatice dedicate analizei ADN, ARN, proteinelor. Cercetătorii din toată lumea pot accesa aceste resurse gratuit pentru a dobândi noi cunoștințe, prin analize asistate de calculator și integrarea datelor.
Programele doctorale și postdoctorale
modificareInstitutul are două programe doctorale: un program de 4 ani pentru studenții cu diplomă de licență în șiințe și un program de 3 ani pentru cei diplomă de medici. Programul de 4 ani permite studenților să lucreze în 3 laboratoare diferite pentru a-și lărgi cunoștințele științifice, înaintea începerii programului de doctorat propriu-zis. Fiecare student trebuie șă-și aleagă cel puțin un proiect experimental și cel puțin unul de informatică. [24]
Institutul are aproximativ 50 de studenți la studiile de licență, toți fiind înregistrați la Universitatea Cambridge.[25]
Fotogalerie
modificare-
Campusul dedicat ADN-ului, din Cambridgeshire, UK -
Campusul dedicat ADN-ului, din Cambridgeshire, UK, iarna -
Clădirea Morgan a Institutului Sanger -
Sculptură din Campusul dedicat ADN-ului -
Scară în formă de helix -
Sculptură de metal din Campusul dedicat ADN-ului -
Sculptură de metal din Campusul dedicat ADN-ului
Note
modificare- ^ „MRC Centre United Kingdom: Wellcome Trust Sanger Institute”. Medical Research Council. Arhivat din original la . Accesat în .
- ^ PMID 24380948 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ doi:10.1146/annurev.bi.57.070188.000245
Această referință va fi completată automat în următoarele minute. Puteți sări peste perioada de așteptare sau puteți extinde citarea manual - ^ „Wellcome Trust Sanger Institute - About us”. Wellcome Trust Sanger Institute. Accesat în .
- ^ „Wellcome Trust Sanger Institute - Sequencing”. Wellcome Trust Sanger Institute. Arhivat din original la . Accesat în .
- ^ Jones, I. „Feature: Highly cited”. Wellcome Trust. Arhivat din original la . Accesat în .
- ^ PMID 25355519 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 24150940 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 25352552 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 22116062 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 24157837 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 24288371 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 25392425 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 24194607 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 18003653 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 24194605 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ „1000 Genomes: A Deep Catalog of Human Genetic Variation”. 1000 Genomes Project. Arhivat din original la . Accesat în .
- ^ „1000 Genomes Project releases data from pilot projects on path to providing database for 2,500 human genomes”. Wellcome Trust Sanger Institute. Arhivat din original la . Accesat în .
- ^ PMID 24424120 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ PMID 24229443 (PubMed)
Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand - ^ „Wellcome Trust launches study of 10,000 human genomes in UK”. Wellcome Trust Sanger Institute. Arhivat din original la . Accesat în .
- ^ „International Cancer Genome Consortium Homepage”. International Cancer Genome Consortium. Accesat în .
- ^ „Wellcome Trust Sanger Institute - ENCODE and GENCODE”. Accesat în .
- ^ „Wellcome Trust Sanger Institute PhD Programmes”. Wellcome Trust Sanger Institute. Accesat în .
- ^ „Sanger PhD and MPhil theses”. Arhivat din original la .